Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDUFA9Q16795 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms