Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP2B3Q16720 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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