Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HIST3H3Q16695 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HIST3H3Q16695 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms