Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF239Q16600 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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