Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGCBQ16585 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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