Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNAPC1Q16533 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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