Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SSX1Q16384 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX1Q16384 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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