Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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NCOA1Q15788 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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NCOA1Q15788 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NCOA1Q15788 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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NCOA1Q15788 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
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NCOA1Q15788 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
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NCOA1Q15788 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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NCOA1Q15788 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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NCOA1Q15788 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NCOA1Q15788 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
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