Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNHIT3Q15649 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNHIT3Q15649 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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