Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF11Q15544 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms