Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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ODF1Q14990 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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