Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3AQ14563 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SEMA3AQ14563 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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