Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HNF4GQ14541 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms