Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM25Q14258 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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