Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPTAN1Q13813 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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