Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ALCAMQ13740 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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