Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1A4Q13733 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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