Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTMR3Q13615 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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