Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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ITGB3BPQ13352 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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ITGB3BPQ13352 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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ITGB3BPQ13352 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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ITGB3BPQ13352 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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ITGB3BPQ13352 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ITGB3BPQ13352 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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