Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRSQ13332 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPRSQ13332 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms