Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHAF1BQ13112 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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