Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIK3Q13003 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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