Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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TRAF2Q12933 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF2Q12933 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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