Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPN13Q12923 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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