Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TWF1Q12792 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms