Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SYCNQ0VAF6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms