Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM27E3Q08E93 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms