Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD300CQ08708 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD300CQ08708 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms