Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CENPEQ02224 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms