Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POU4F1Q01851 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POU4F1Q01851 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms