Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1DQ01668 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNA1DQ01668 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms