Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFITM3Q01628 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms