Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLTCQ00610 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLTCQ00610 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms