Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDK16Q00536 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms