Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMF1P82094 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMF1P82094 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMF1P82094 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMF1P82094 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms