Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCL7P80098 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCL7P80098 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms