Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SNRPNP63162 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms