Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAP1AP62834 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms