Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ARF6P62330 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARF6P62330 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARF6P62330 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ARF6P62330 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms