Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR2FP61218 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms