Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLTPP55058 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLTPP55058 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms