Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLTCL1P53675 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLTCL1P53675 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms