Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORCP51449 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORCP51449 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORCP51449 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RORCP51449 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms