Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLK1P49759 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLK1P49759 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLK1P49759 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms