Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CSNK1EP49674 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms