Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP5OP48047 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP5OP48047 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms