Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNPDA1P46926 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNPDA1P46926 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms