Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFBP38117 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFBP38117 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFBP38117 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFBP38117 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFBP38117 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETFBP38117 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETFBP38117 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ETFBP38117 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms