Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms