Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACVR1BP36896 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACVR1BP36896 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms